La Assemblea General es el órgano de gobierno integrado por todas las Asociaciones Locales y Federaciones Territoriales, se reúne anualmente para dar cita los delegados de toda la red de Juventudes Musicales para tejer conjutamente las estrategias de presente y futuro de la entidad.
El consejo de dirección es la junta directiva y órgano ejecutivo de la entidad, actualmente responsable del mandato 2016-2020.
El equipo profesional está integrado por un grupo de profesionales repartidos entre las sedes de Barcelona y Madrid, responsables de los distintos departamentos.
