Tal como se indica en los Estatutos de la Confederación de Juventudes Musicales de España la Asamblea General de la Confederación "es el órgano supremo de gobierno y se integra por todas las Asociaciones Locales y Federaciones Territoriales". Así pues la Asamblea General que se reúne anualmente con carácter ordinario es uno de los momentos más importantes de la actividad de Juventudes Musicales de España ya que en ella se dan cita los delegados de toda la red de Juventudes Musicales para discutir y aprovar las estrategias de presente y futuro de la entidad.
La Asamblea General Ordinaria es itinerante y se celebra cada año en una sede local diferente de Juventudes Musicales. En la última década han acogido la Asamblea General Ordinaria las siguientes Asociaciones Locales:
2011: Gijón
2010: Girona
2009: Sober
2008: Ciutadella de Menorca
2007: Almuñécar
2006: Alcalá de Henares
2005: Alcalá de Henares
2004: Barcelona
2003: Vigo
2002: Madrid
2001: Alcalá de Henares
2000: Sevilla
